[python-nl] Python-nl Digest, Vol 110, Issue 1

[Kramer, Koen]

Dank. Ik heb het boek bestld. Kwam nog een mooie Python module tegen over visalisatie en workflow managemetn VisTrails : http://www.vistrails.org/index.php/Main_Page#VisTrails_Overview

Groet, Koen

Op 3 sep. 2013 om 12:03 heeft "python-nl-request at python.org<mailto:python-nl-request at python.org>" <python-nl-request at python.org<mailto:python-nl-request at python.org>> het volgende geschreven:

Send Python-nl mailing list submissions to
   python-nl at python.org<mailto:python-nl at python.org>

To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit
   https://mail.python.org/mailman/listinfo/python-nl
or, via email, send a message with subject or body 'help' to
   python-nl-request at python.org<mailto:python-nl-request at python.org>

You can reach the person managing the list at
   python-nl-owner at python.org<mailto:python-nl-owner at python.org>

When replying, please edit your Subject line so it is more specific
than "Re: Contents of Python-nl digest..."


Today's Topics:

  1. data visualisate met Python - pandas (Kramer, Koen)
  2. Re: data visualisate met Python - pandas (Guido Kollerie)


----------------------------------------------------------------------

Message: 1
Date: Mon, 2 Sep 2013 13:36:22 +0000
From: "Kramer, Koen" <koen.kramer at wur.nl<mailto:koen.kramer at wur.nl>>
To: "'python-nl at python.org<mailto:python-nl at python.org>'" <python-nl at python.org<mailto:python-nl at python.org>>
Subject: [python-nl] data visualisate met Python - pandas
Message-ID:
   <9ACEF269E6A35F49A558A24EB83B19A621CFB62C at SCOMP0933.wurnet.nl<mailto:9ACEF269E6A35F49A558A24EB83B19A621CFB62C at SCOMP0933.wurnet.nl>>
Content-Type: text/plain; charset="us-ascii"

Beste mensen,

Hierbij mijn eerste vraag in de PUN wereld. Ik ben beginnend met python, vanuit een achtergrond met vooral Fortran / Pascal. Waar ik tegenaan loop is de visualisatie (lijnen, histogrammen) van vrije grote databases (10^5 - 10^6 records) van de uitvoer van een bos-groei model waar ik we gevoeligheidsanalyses mee hebben uitgevoerd.

In ipython heb ik de volgende stappen gemaakt:

import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pylab as plt

data = pd.read_csv(VolInc.csv')

grouped = data.groupby(['Spec','Precip','Temp','CO2'])

ter toelichting op de data structuur:

-      De gegroepeerde factoren zijn in een aantal levels gevarieerd (bv vier boomsoorten, 3 neerslag niveaus, etc).

-      Alle combinaties van de factoren zijn door het model langsgelopen. Een unieke combinatie van factoren wordt 1 scenario genoemd.

-      alle scenario's zijn meerdere keren herhaald omdat er stochastische componenten in het model zitten.

-      Een model run bestaat uit meerdere jaren. Een unieke index bestaat dus uit de combinatie van scenario-replica-jaar.

-      De uitkomsten van het model staan in 1 of meerdere value kolommen (bv volume toename van de stam)

Een paar tips om de data op verschillende manieren te visualiseren om op gang te komen zouden erg handig zijn. Mn:

-      Value-kolom op y-as, en tijd (year) weergeven op x-as,

-      filteren op factor-values (waarden van 2 factoren vastzetten, en van derde factor weergeven op x-as)

-      species en / of factoren weergeven in legenda

-      factoren over verschillende figuren verdelen

-      titles van plots, x-as en legenda uit factor waarden halen

-      replica's in error bars weergeven

Ik hoop dat iemand die ervaring heeft met python om vergelijkbare data te visualiseren me wat werkende code aan de hand kan doen waarop ik kan voortborduren

Groet,

Koen


-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://mail.python.org/pipermail/python-nl/attachments/20130902/f60b4d1c/attachment-0001.html>

------------------------------

Message: 2
Date: Mon, 2 Sep 2013 16:00:13 +0200
From: Guido Kollerie <guido at kollerie.com<mailto:guido at kollerie.com>>
To: Dutch Python developers and users <python-nl at python.org<mailto:python-nl at python.org>>
Subject: Re: [python-nl] data visualisate met Python - pandas
Message-ID:
   <CAArq9V-RZL4k834NUBCtn=fEDgtq8wk7CSQO+0Lb1R8iVR90zA at mail.gmail.com<mailto:CAArq9V-RZL4k834NUBCtn=fEDgtq8wk7CSQO+0Lb1R8iVR90zA at mail.gmail.com>>
Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

2013/9/2 Kramer, Koen <koen.kramer at wur.nl<mailto:koen.kramer at wur.nl>>:

Ik hoop dat iemand die ervaring heeft met python om vergelijkbare data te
visualiseren me wat werkende code aan de hand kan doen waarop ik kan
voortborduren

Heb recentelijk redelijk wat werk verricht mbv Pandas (doch geen
visualisaties). Het boek: Python for Data Analysis van Wes McKinney
(http://shop.oreilly.com/product/0636920023784.do) was daarbij
onmisbaar. Ik heb het er net even op nageslagen; het heeft ??n
hoofdstuk (hfd 8) Plotting and Visualization van zo'n 30 pagina's. Het
lijkt me de meest uitgebreide informatie die je op dit gebied kan
vinden.

Groeten, Guido


------------------------------

Subject: Digest Footer

_______________________________________________
Python-nl mailing list
Python-nl at python.org<mailto:Python-nl at python.org>
https://mail.python.org/mailman/listinfo/python-nl


------------------------------

End of Python-nl Digest, Vol 110, Issue 1
*****************************************