Comparar y extraer

[areyes en dsic.upv.es]

Hola,
estoy iniciando en cuestiones de programación y de tratamiento de  
lenguaje natural.
Mi pregunta es la siguiente, tengo 2 archivos, el primero tiene el formato:
      abuse
      abatament
      comunication
      dye
      Wn
El segundo tiene el siguiente:
      abatement       2       3       @       ~
      acute_leukemia  1       2       @       ~
      acute_lymphoblastic_leukemia    1       1       @       1
      acute_lymphocytic_leukemia      1       1       @       1
      acute_myelocytic_leukemia       1       1       @       1
      acute_myeloid_leukemia  1       1       @       1
      acute_organic_brain_syndrome    1       1       @       1
      acute_pyelonephritis    1       1       @       1
Quiero saber cómo puedo comparar el archivo 1 con el 2 y si en el  
archivo 2 aparece una palabra del 1, copiar toda la línea en un  
archivo nuevo, de la fomra siguiente:

si abatament en 2:
entonces ['abatement       2       3       @       ~'] se copie a  
archivo nuevo

Espero haberme podido explicar. Gracias por su ayuda.
Antonio


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